上海市中医医院位于上海市芷江中路274号，创建于1954年，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级综合性中医医院。 
上海市中医医院身为1954年9月1日建立的上海市立中医门诊部。1979年划归市卫生局，改称上海市中医医院。 
2005年，成为上海中医药大学非直属附属医院。 2010年，医院的中医儿科被选作国家中管局重点扶植的学科之一，并联合龙华、曙光和岳阳其他3所上海中医药大学附属医院，联合申报成立了中医儿科研究所。